自然再生事業には「保全」から「創出」までいくつかのステージがありますが、現地の状況にあわせてそれらを効果的に使い分け・組み合わせて実施されます。事業はできるだけ自然の回復力に委ねるかたちで実施され、科学的なデータに基づいて様々な評価や判断がなされます。
湿原生態系は様々な生態系のなかでも特に消失率が高く劣化も激しいことから、国が主導する国内初の自然再生事業の対象となりました。湿原の象徴でもある釧路湿原が事業地に選定され、その辺縁部にあたる広里地区で先導的に再生事業が始まりました。まずは劣化状況に関する調査が行われ、過去の河川流路切り替え工事に起因する深刻な乾燥化が現地で生じていることが明らかとなりました。その対策として、湿原への河川水供給や湿原からの排水阻止を目的とした事業提案がなされました。しかし、それらの事業を通じた人間活動（漁業や農業）への悪影響が懸念されるなど、広里地区では様々な困難が立ちはだかり再生事業が進むことなく終焉となりました。
自然再生事業（しぜんさいせいじぎょう）は、しぜんを とりもどす とりくみです。「いまある 自然を まもる（保全）」ことから「新しく 自然を つくる（創出）」ことまで、いくつかの 段階（だんかい）が あります。その ばしょの じょうたいに 合わせて、うまく くみあわせて おこなわれます。
この とりくみは、できるだけ 自然が 自分で 元に もどろうとする 力を 大切にして おこなわれ、かがくてきな データや 調査（ちょうさ）を もとに 評価や 判断が されます。
湿原（しつげん）の 生態系は、ほかの 自然環境の なかでも なくなりやすい、いたみも はげしいことから、国が 主導する 日本で はじめての 自然再生事業の 場所に えらばれました。
しつげんの 代表でもある 釧路湿原（くしろしつげん）が 事業の 場所として えらばれ、その はしの ほうにある 広里（ひろさと）地区で はじめの とりくみが スタートしました。
まず、しつげんが どれくらい 傷んでいるか（劣化状況）の 調査が おこなわれました。そのけっか 昔 おこなわれた 川の流れを かえる 工事の せいで 乾燥化（水が なくなって かわいてしまうこと）が 起きていることが わかりました。
その 対策として、しつげんに 川の 水を ながしこんだり、しつげんから 水が ぬけていくのを ふせいだりする 計画が 提案されました。
しかし、これらの とりくみによって、近くで くらす 人々の しごと（漁業や 農業）に わるい 影響が 出るのではないかと 心配されるなど、広里地区では いろいろな むずかしい 問題が たちふさがり、とりくみが すすまないまま 終わってしまうことに なりました。
比較的少規模の自然再生事業ですが、北海道能取湖畔の塩湿地で行われたアッケシソウ群生地の再生は成功事例の一つとして知られています。秋に赤く紅葉し赤い絨毯のような景観で知られる能取湖のアッケシソウ群生地は、不適切な管理（盛り土等）が原因で一度全滅してしまいました。観光地でもあった群生地の再生を強く求める地元の声に応えるかたちで事業が始まり、状況把握調査・原因解析・対策工事が行われました。全滅の原因は、盛り土に使用された浚渫土が乾燥し極度の酸性土壌が生じたことにありました。土壌の乾燥を回避し中和するために湖水の引き込みや地盤の掘り下げを行い、約5年間かけてもとの群生地へと無事再生しました。
北海道の 能取湖（のとりこ）の ほとりにある 塩湿地（えんしっち）で おこなわれた アッケシソウの 群生地（ぐんせいち）を とりもどす とりくみは、うまくいった 例として 知られています。
秋になると 真っ赤に 色がかわり まるで「赤のじゅうたん」のような 美しい 風景で 有名な 能取湖のアッケシソウ群生地（ぐんせいち）は、つちを 盛りあげる 工事などが 原因で、一度 ぜんぶ なくなって しまいました。
観光地でもあった この 場所を「もう一度 とりもどしてほしい」という 地元の人々の つよい 願いに こたえる かたちで とりくみが スタートし、調査や 原因の 分析、直すための 工事がおこなわれました。
全滅してしまった 原因は、つちを 盛るときに つかわれた すなや つち（浚渫土：しゅんせつど）が かわいて、とても つよい 酸性（さんせい）の つちに なってしまったことに ありました。
つちが かわくのを ふせぎ、さんせいを やわらげる（中和する）ために、みずうみの 水を ひきこんだり、地面を ほりさげたりする 工事を おこない、およそ 5年間の 時間を かけて、もとの 美しい 群生地を とりもどすことが できました。
ここで取り上げた二つの自然再生事業は対照的な結末となりましたが、事業の成否を決める重要なポイントは、周辺の人間活動に対する干渉程度や地域住民の意向なのかもしれません。
ここで 取り上げた 二つの とりくみは、まったく ちがう 結果に なりました。
事業が うまくいくか どうかを 決めるために いちばん大切なことは、まわりの 人たちの くらしや 仕事に どれくらい 影響が 出るか、そして 地域に すむ 人たちが「やってほしい」と 思っているかどうかという 気持ち なのかもしれません。